Decreto de creación. En el decreto de creación del Comando de la Flota (COMFLO), Decreto del Poder Ejecutivo Nº 849/985 del 30 de Diciembre de 1985; en su Artículo 3° inciso b.- se establece el "Estado Mayor de la Flota" como parte integrante de la  Flota.  Constituye un Estado Mayor Operativo al que le compete auxiliar al Comandante en la selección y en la implementación de soluciones efectivas para los problemas que se le presenten.

Organización del Estado Mayor del Comando de la Flota: La O/I COMFLO Nº 6035.2/2007, establece la actual Organización Administrativa del Estado Mayor.

MISION

El Estado MAYOR del  Comando de la Flota es el órgano asesor, coordinador y planificador que apoya al Comandante de la Flota en el  ejercicio de sus funciones de mando.

TAREAS

Son tareas generales y primarias del Estado Mayor de la Flota:

• Asesora al Comandante en todas las áreas de decisión que este lo requiera.
• Se mantiene informado de las decisiones y políticas del Comandante.
• Transmitir decisiones  elaborando planes, directivas, instrucciones, etc.
• Velar por la difusión y cumplimiento de las órdenes del Comandante
• Proporciona al Mando elementos de juicio y datos para la toma de decisiones
• Mantiene al Comandante informado en forma permanente, de la situación de las fuerzas  propias y enemigas.
• Mantiene informado al Comandante de las situaciones corrientes y en desarrollo.
• Supervisa el cumplimiento de “La Acción Planificada”.
• Mantiene al día las apreciaciones, planes y ordenes necesarias que le permitan informar  y asesorar al Comandante en tiempo y forma.
• Efectúa Apreciaciones y Estudios de EM.
• Se mantiene alistado para en caso de guerra, asesorar al Comandante referente a los enlaces con otros Comandos Operacionales, mediante la planificación y estudio de los planes y órdenes necesarios para esta situación específica; para lo cual debe conocer e interpretar el Concepto del  Comandante.
• Mantener el alistamiento operativo y soporte logístico del Centro de Operaciones Tácticas (COT)